288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3579 on replicon NC_009470
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  47.58 
 
 
228 aa  202  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  47.71 
 
 
226 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  46.43 
 
 
231 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  44.14 
 
 
228 aa  187  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.95 
 
 
228 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  44.14 
 
 
228 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  44.14 
 
 
228 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  42.47 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.37 
 
 
238 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.7 
 
 
232 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.28 
 
 
237 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  40.83 
 
 
238 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  35.81 
 
 
252 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  35.87 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  29.41 
 
 
260 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  29.91 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  28.95 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.95 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  28.27 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  33.15 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  32.16 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  26.76 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  26.67 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  27.56 
 
 
233 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 
217 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  25.54 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
231 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  30.39 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  33.58 
 
 
250 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  24.45 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  34.44 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.19 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.54 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.46 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  28.8 
 
 
309 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.36 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.66 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.9 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
205 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 
217 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 
212 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 
226 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  31.34 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.98 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  22.18 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.82 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.13 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  25.96 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.61 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.63 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  26.87 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  22.61 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  30.56 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  27.87 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
216 aa  52  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
212 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.51 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.08 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.51 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.51 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.59 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  34.96 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.51 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  26.09 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  27.47 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>