More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3553 on replicon NC_009470
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  359  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  70.95 
 
 		 184 aa  248  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  68.89 
 
 		 183 aa  243  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  66.45 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  51.11 
 
 		 188 aa  164  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  50 
 
 		 191 aa  157  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  48.62 
 
 		 190 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  44.44 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  51.12 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  45.77 
 
 		 199 aa  147  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  45.77 
 
 		 201 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  50.34 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  47.78 
 
 		 196 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  47.78 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.08 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  44.94 
 
 		 184 aa  138  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  43.26 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  47.75 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.37 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  44.38 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  41.57 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  43.01 
 
 		 201 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  44.07 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  43.26 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  46.29 
 
 		 191 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  46.29 
 
 		 191 aa  134  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  41.08 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  47.09 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  47.78 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  43.26 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  43.26 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  42.13 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  42.13 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  43.26 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  39.89 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  43.5 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  39.89 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  45.65 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  38.89 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  41.57 
 
 		 189 aa  127  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  48.23 
 
 		 190 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  43.58 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  41.01 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  43.58 
 
 		 205 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  43.58 
 
 		 205 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  42.86 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  38.8 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  41.44 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  46.43 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  43.93 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 		 203 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 189 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  39.11 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  47.86 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  41.71 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.33 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  47.55 
 
 		 298 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  41.21 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  43.87 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  42.39 
 
 		 201 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  39.11 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  47.55 
 
 		 326 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  42.94 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  47.55 
 
 		 293 aa  121  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  45.35 
 
 		 293 aa  121  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 191 aa  120  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  51.61 
 
 		 209 aa  120  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  46.85 
 
 		 305 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  48.25 
 
 		 294 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.89 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  43.43 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.25 
 
 		 198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  48.63 
 
 		 205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  49.25 
 
 		 313 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  47.55 
 
 		 294 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 307 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 307 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  43.1 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  50 
 
 		 309 aa  118  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>