23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3353 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3353  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  266  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  37.29 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 272 aa  42  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 68 aa  42  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  34.85 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  25.56 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3420  transcriptional regulator, XRE family protein  36.51 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03330  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 100 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.312142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>