30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3315 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  97.73 
 
 		 529 aa  1048    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  100 
 
 		 529 aa  1070    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  47.89 
 
 		 546 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  43.23 
 
 		 560 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.84 
 
 		 534 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  34.07 
 
 		 528 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  33.94 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  36.85 
 
 		 564 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.05 
 
 		 555 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  35.38 
 
 		 521 aa  263  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.9 
 
 		 539 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.81 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.77 
 
 		 534 aa  247  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  33.53 
 
 		 511 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.53 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.07 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.72 
 
 		 520 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.72 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.39 
 
 		 523 aa  242  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  32.55 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  37.13 
 
 		 511 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  35.57 
 
 		 534 aa  227  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  31.79 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  31.41 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.98 
 
 		 508 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  29.54 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  29.41 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  28.25 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.97 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  26.97 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>