More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3237 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  81.48 
 
 		 140 aa  218  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  82.03 
 
 		 139 aa  215  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  78.91 
 
 		 133 aa  213  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  65.62 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 136 aa  171  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  63.28 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 131 aa  157  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  51.97 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  55.12 
 
 		 140 aa  137  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  53.17 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  53.97 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  46.46 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  45.67 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 141 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  46.83 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  47.62 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 146 aa  121  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  44.09 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 137 aa  116  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  52.78 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  44.53 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  48.15 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  48.15 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  46.56 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  42.31 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  41.09 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  45.31 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  42.64 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  43.41 
 
 		 159 aa  106  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 		 169 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  44.88 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  47.32 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  43.07 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  42.75 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.09 
 
 		 156 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 182 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>