65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3193 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3193  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.324962  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3148  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0753  XRE family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.057083  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  26.95 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0016  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0443  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000554716  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0021  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 140 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3923  XRE family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.680179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_004310  BR2159  Cro/CI family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00000314405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2071  Cro/CI family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0247654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0045  XRE family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000742068  hitchhiker  0.0000000000614145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1232  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236768  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0014  transcriptional regulator, XRE family  24.62 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.881591  normal  0.120221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2892  transcriptional regulator, XRE family  25.19 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0026  XRE family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153059  normal  0.660956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3622  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3038  XRE family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 140 aa  51.6  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6504  transcriptional regulator, XRE family  24.82 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 119 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7073  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1815  XRE family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843474  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 		 123 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6091  transcriptional regulator, XRE family  23.94 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2959  transcriptional regulator, XRE family  22.37 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676432  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3775  XRE family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 123 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1061  XRE family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.161431  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8067  transcriptional regulator  24.43 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.262846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3208  transcriptional regulator, XRE family  26.39 
 
 		 141 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3598  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00212083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 138 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  21.9 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2505  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3777  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  44.7  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  37.14 
 
 		 327 aa  44.7  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0558597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1221  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.121494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2935  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 128 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1502  XRE family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  21.58 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  34.92 
 
 		 131 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  21.01 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  43.33 
 
 		 349 aa  43.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1149  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 120 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.016899  hitchhiker  0.00000234075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0237  XRE family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 139 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7198  transcriptional regulator, XRE family  27.34 
 
 		 134 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0637638 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6040  transcriptional regulator, XRE family  24.46 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.591688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>