223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3188 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3188  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0815564  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1030  hypothetical protein  99.52 
 
 
207 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0031  ISMca6, transposase, OrfA  54.35 
 
 
179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1611  ISMca6, transposase, OrfA  54.35 
 
 
179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  34.83 
 
 
378 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  34.27 
 
 
263 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  34.27 
 
 
258 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  34.83 
 
 
378 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  34.27 
 
 
378 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  34.27 
 
 
378 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  34.27 
 
 
378 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  34.27 
 
 
378 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  34.27 
 
 
378 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  34.27 
 
 
253 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  35.09 
 
 
378 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1544  ISEc1, transposase  33.71 
 
 
263 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.59802  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  33.71 
 
 
378 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  33.71 
 
 
378 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  33.71 
 
 
378 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2196  transposase IS4 family protein  33.71 
 
 
263 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398204  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  33.71 
 
 
378 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  34.27 
 
 
378 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  37.22 
 
 
372 aa  92  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  33.7 
 
 
248 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  33.7 
 
 
248 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  37.85 
 
 
372 aa  91.7  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  37.85 
 
 
372 aa  91.3  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  37.85 
 
 
372 aa  91.3  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  33.7 
 
 
374 aa  88.6  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  38 
 
 
327 aa  88.2  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  30.68 
 
 
388 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  30.68 
 
 
388 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  30.68 
 
 
388 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  30.68 
 
 
388 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  30.68 
 
 
388 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  30.68 
 
 
388 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  30.68 
 
 
388 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  33.52 
 
 
374 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  33.52 
 
 
374 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  33.52 
 
 
374 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  32.04 
 
 
377 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  33.15 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  31.98 
 
 
370 aa  85.9  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  33.14 
 
 
373 aa  85.1  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  31.28 
 
 
393 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2930  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
253 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  32.02 
 
 
253 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  31.49 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  32.39 
 
 
374 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2439  transposase, IS4  32.39 
 
 
374 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  33.7 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1127  transposase, IS4  31.28 
 
 
290 aa  82  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00666  hypothetical protein  30.9 
 
 
253 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00655  hypothetical protein  30.9 
 
 
253 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0477  transposase, IS4  31.82 
 
 
374 aa  82  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  31.82 
 
 
374 aa  82  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2994  transposase (IS4)  32.84 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486834  normal  0.519471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2070  transposase, IS4  31.64 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  32.63 
 
 
395 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  33.16 
 
 
395 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  32.63 
 
 
367 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  30.81 
 
 
373 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5649  transposase ISAs1 family protein  30.6 
 
 
377 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3911  transposase ISAs1 family protein  30.6 
 
 
377 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5630  transposase ISAs1 family protein  30.6 
 
 
377 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000338804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>