84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3075 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  100 
 
 
173 aa  342  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  44.6 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6047  hypothetical protein  36.84 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  36.31 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  36.24 
 
 
165 aa  89  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  33.8 
 
 
154 aa  82  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.6 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  33.55 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.9 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  32.7 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.7 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  32.7 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  32.7 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  32.67 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.41 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.9 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.05 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  31.45 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  35.14 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  32 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  37.11 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  36.48 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  31.87 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.08 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.3 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  34.15 
 
 
167 aa  57.4  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.18 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.17 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  29.17 
 
 
160 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  29.17 
 
 
160 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2766  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.17 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0113374  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.99 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  29.49 
 
 
170 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  31.79 
 
 
248 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  28.75 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4955  hypothetical protein  28.33 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.25 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  28.31 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  30.51 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  28.49 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.22 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.04 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  29.38 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.58 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  28.41 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.84 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.17 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  35 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  26.67 
 
 
141 aa  44.3  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  26.35 
 
 
136 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  30.67 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  26.92 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  28.86 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.5 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  27.03 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  31.47 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  28.19 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  34.21 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  28.19 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  34.21 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  34.21 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  34.21 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  34.21 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  28.19 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  34.21 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  28.12 
 
 
235 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  28.12 
 
 
235 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.03 
 
 
173 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  30 
 
 
148 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>