89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3070 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  100 
 
 
372 aa  724    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  30.56 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  31.81 
 
 
368 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  30.96 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  34.24 
 
 
358 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3024  ImpA-like  33.42 
 
 
359 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  28.1 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  31.94 
 
 
357 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  33.94 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  27.99 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.99 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  27.76 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.23 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  27.76 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.76 
 
 
373 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  28.57 
 
 
369 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  28.72 
 
 
373 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  28.72 
 
 
373 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  28.97 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  28.97 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  28.72 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  28.97 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  28.97 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  27.71 
 
 
365 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.51 
 
 
369 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  28.27 
 
 
371 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  26.12 
 
 
364 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.53 
 
 
364 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  28.98 
 
 
383 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.79 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  25.99 
 
 
361 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  25.73 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.79 
 
 
382 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  28.91 
 
 
366 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  29.44 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  33.33 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  27.1 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.69 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  27.9 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.33 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  26.42 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  26.74 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  29.84 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.36 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.41 
 
 
339 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  27.12 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.21 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  36.44 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  24.58 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1169  putative type VI secretion protein VasJ-1  19.95 
 
 
461 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  28.4 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  24.93 
 
 
365 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  33.62 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  33.62 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  22.61 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  36.36 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  23.46 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  26.48 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  29.06 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  29.75 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  29.75 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  29.75 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  29.75 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  29.75 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  29.75 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  29.75 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  25.86 
 
 
356 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  26.25 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  43.33 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  43.33 
 
 
437 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  27.59 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  28.93 
 
 
354 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  24.93 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  32.95 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  25 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  32.95 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  32.95 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  32.95 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  32.95 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  32.95 
 
 
300 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  32.95 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  24.27 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  25.21 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  25.56 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  30 
 
 
790 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  25.21 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  26.27 
 
 
533 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  31.36 
 
 
463 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  27.12 
 
 
522 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>