49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3040 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  100 
 
 
197 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  37.82 
 
 
215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  30.21 
 
 
203 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.62 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.87 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  35.68 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  34.95 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  32.79 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  32.79 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  31.03 
 
 
279 aa  72  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  31.58 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  32.98 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  32.98 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  32.98 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  32.45 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  38.52 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.89 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  33.67 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  34.17 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  38.24 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  39.64 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  36.84 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  30.47 
 
 
248 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  33.86 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  26.74 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  40 
 
 
271 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  31.87 
 
 
262 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  45.07 
 
 
244 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  34.21 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.08 
 
 
220 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.26 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  32.81 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 
219 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  37.66 
 
 
222 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.1 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  34.13 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  36.11 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  33.77 
 
 
253 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  38.96 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.68 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.27 
 
 
147 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
201 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.17 
 
 
209 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.94 
 
 
217 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.48 
 
 
189 aa  41.2  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>