281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3022 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3022  amidase  100 
 
 
442 aa  875    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  51.09 
 
 
420 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  49.39 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  50.36 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  49.76 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  51.09 
 
 
420 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  49.76 
 
 
426 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  50 
 
 
426 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  49.03 
 
 
426 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  49.76 
 
 
426 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  49.51 
 
 
426 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  49.76 
 
 
426 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  50.37 
 
 
418 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  50.12 
 
 
421 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  49.02 
 
 
426 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  50.37 
 
 
418 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  48.8 
 
 
425 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  50.25 
 
 
423 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  49.88 
 
 
418 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  50.37 
 
 
418 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  49.88 
 
 
418 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  47.91 
 
 
411 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  50.25 
 
 
423 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  49.38 
 
 
425 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  49.38 
 
 
425 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  49.38 
 
 
423 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.39 
 
 
428 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  51.6 
 
 
423 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  48.28 
 
 
412 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  47.91 
 
 
416 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  50.61 
 
 
415 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  50.37 
 
 
423 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  48.05 
 
 
420 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  48.52 
 
 
413 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  48.4 
 
 
422 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  48.14 
 
 
427 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  48.79 
 
 
418 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  50.24 
 
 
421 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  47.52 
 
 
408 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  46.23 
 
 
415 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  45.99 
 
 
415 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  48.7 
 
 
459 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  48.7 
 
 
459 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  47.52 
 
 
421 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  49.51 
 
 
429 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  48.13 
 
 
479 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  50.85 
 
 
414 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  48.93 
 
 
471 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.76 
 
 
418 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  46.81 
 
 
416 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  45.26 
 
 
415 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  47.16 
 
 
424 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  48.02 
 
 
420 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  47.19 
 
 
424 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  50.73 
 
 
420 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.04 
 
 
412 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  50.73 
 
 
420 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.17 
 
 
422 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  46.55 
 
 
420 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  48.29 
 
 
418 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  50.73 
 
 
420 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.97 
 
 
418 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  50.49 
 
 
420 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  45.34 
 
 
416 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  50.73 
 
 
420 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  47.28 
 
 
421 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  50.73 
 
 
420 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  50.73 
 
 
420 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  49.01 
 
 
427 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  49.26 
 
 
429 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  49.14 
 
 
419 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  48.46 
 
 
459 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  48.52 
 
 
427 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  48.46 
 
 
459 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  48.46 
 
 
459 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  49.63 
 
 
431 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  48.46 
 
 
459 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  49.26 
 
 
523 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  46.68 
 
 
416 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  48.64 
 
 
427 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  47.42 
 
 
431 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  48.17 
 
 
427 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  48.01 
 
 
427 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.06 
 
 
426 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  46.93 
 
 
411 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  48.28 
 
 
427 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  46.57 
 
 
419 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  48.52 
 
 
427 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.44 
 
 
430 aa  359  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  43.32 
 
 
423 aa  359  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  46.57 
 
 
426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  46.31 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  46.57 
 
 
419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  46.57 
 
 
419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  47.91 
 
 
415 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  45.45 
 
 
416 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  44.85 
 
 
416 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4391  amidase  48.91 
 
 
428 aa  348  9e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131322  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  44.8 
 
 
409 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  46.44 
 
 
415 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>