More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3017 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  683    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  42.78 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  40.11 
 
 		 375 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  46.44 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  39.44 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  36.31 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  43.39 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  36.36 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  34.16 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  38.03 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  34.05 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  35.91 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  35.67 
 
 		 387 aa  175  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  35.47 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  33.82 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  34.47 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  34.48 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  33.63 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  33.94 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  34.95 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  34.34 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  34.9 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  40.5 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  33.73 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  34.29 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  44.72 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  35.06 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  33.62 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  34.94 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  33.53 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  32.61 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  33.03 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  28.39 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  32.65 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  33.54 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  34.8 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  34.8 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  33.16 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  33.59 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  32.14 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  34.41 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  34.52 
 
 		 383 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  35.03 
 
 		 377 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  33.07 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  34.12 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  30.75 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  39.55 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  29.57 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  31 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  35.12 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  33.24 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  35.12 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  42.58 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  39.21 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  40.09 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  35.31 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  29.91 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  38.1 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  29.27 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  29.27 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  29.3 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  41.32 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  33.63 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  32.93 
 
 		 384 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0920  hypothetical protein  35.29 
 
 		 374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  44.4 
 
 		 401 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  31.47 
 
 		 374 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  31.48 
 
 		 374 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  42.91 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0799  protein of unknown function DUF140  43.59 
 
 		 216 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.745929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  31.86 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  32.62 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  32.12 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  31.21 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  31.47 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  26.55 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  29.84 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  38.87 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  32.93 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  34.76 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  37.79 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  31.91 
 
 		 368 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  30.61 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  36.97 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  36.97 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  34.76 
 
 		 374 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  36.32 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  29.89 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3498  hypothetical protein  42.39 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  32.24 
 
 		 386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  33.25 
 
 		 376 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  41.26 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  36.32 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  32.32 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  32.24 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  31.32 
 
 		 391 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  40.09 
 
 		 250 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  38.57 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>