More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3004 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
390 aa  772    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  44.59 
 
 
392 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  42.67 
 
 
386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  42.16 
 
 
396 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  43.83 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  37.73 
 
 
373 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  44.5 
 
 
393 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  42.12 
 
 
396 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  40.15 
 
 
393 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  39.65 
 
 
393 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  40.89 
 
 
391 aa  225  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  40.37 
 
 
397 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  35.23 
 
 
389 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.5 
 
 
393 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  42.31 
 
 
264 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.99 
 
 
393 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.99 
 
 
393 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.99 
 
 
393 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.99 
 
 
393 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.64 
 
 
402 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.99 
 
 
393 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.22 
 
 
400 aa  189  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 
279 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 
279 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  39.92 
 
 
265 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1118  3-oxoadipate enol-lactonase  45.9 
 
 
266 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  40.86 
 
 
263 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  41.13 
 
 
266 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  39.84 
 
 
261 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  38.4 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  40.78 
 
 
263 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  39.25 
 
 
261 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  38.87 
 
 
261 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  38.87 
 
 
261 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  36.82 
 
 
263 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  38.87 
 
 
261 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  41.09 
 
 
263 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 
269 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  38.52 
 
 
279 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  40.22 
 
 
282 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  39.25 
 
 
261 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  39.55 
 
 
282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  39.22 
 
 
262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  40.87 
 
 
262 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  39.25 
 
 
261 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  38.87 
 
 
261 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  35.25 
 
 
260 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 
275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  38.82 
 
 
256 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  38.82 
 
 
256 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  35.85 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  35.85 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  38.82 
 
 
256 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  37.89 
 
 
260 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 
260 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.11 
 
 
261 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  39.77 
 
 
263 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  36.98 
 
 
268 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  37.36 
 
 
261 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  37.36 
 
 
261 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  37.36 
 
 
261 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  37.36 
 
 
261 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  37.36 
 
 
261 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.36 
 
 
261 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.16 
 
 
128 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  61.98 
 
 
130 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  37.11 
 
 
260 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  35.41 
 
 
268 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  34.77 
 
 
271 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  38.91 
 
 
263 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  36.9 
 
 
266 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.33 
 
 
131 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  35.2 
 
 
261 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
263 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  38.64 
 
 
265 aa  156  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.02 
 
 
128 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.34 
 
 
128 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 
265 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  37.25 
 
 
255 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
263 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.02 
 
 
128 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  36.26 
 
 
263 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  39 
 
 
263 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 
128 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 
128 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 
129 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 
129 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 
129 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 
262 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  37.55 
 
 
425 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  36.18 
 
 
263 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  39 
 
 
263 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  38.85 
 
 
263 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  37.45 
 
 
262 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  39 
 
 
263 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 
128 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 
128 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  37.45 
 
 
262 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 
128 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 
128 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>