43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2942 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
477 aa  966    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  58.09 
 
 
320 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  42.93 
 
 
879 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  53.85 
 
 
785 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  40.45 
 
 
444 aa  279  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  39.77 
 
 
456 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  39.77 
 
 
459 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  56.85 
 
 
249 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  56.85 
 
 
249 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  47.32 
 
 
447 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  42.42 
 
 
342 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  44.44 
 
 
271 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  46.88 
 
 
409 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  36.47 
 
 
1644 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  36.47 
 
 
1644 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  43.26 
 
 
243 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  36.88 
 
 
265 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  36.69 
 
 
314 aa  167  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  29.9 
 
 
219 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  30.81 
 
 
256 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  26.36 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  45.24 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  26.04 
 
 
231 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  25.81 
 
 
569 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2169  hypothetical protein  28.26 
 
 
708 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1267  methyltransferase FkbM family  25.23 
 
 
255 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
442 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  32.21 
 
 
280 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  22.22 
 
 
264 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  29.56 
 
 
1119 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2335  methyltransferase FkbM  28.57 
 
 
233 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352701  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  31.67 
 
 
268 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  26.67 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  22.89 
 
 
442 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  26.74 
 
 
326 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  26.09 
 
 
228 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  26.63 
 
 
784 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  25 
 
 
567 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  23.57 
 
 
278 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  20.56 
 
 
543 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  27.11 
 
 
235 aa  43.5  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  25.35 
 
 
238 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  23.57 
 
 
278 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>