More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2936 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  54.26 
 
 
738 aa  737    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  53.39 
 
 
728 aa  759    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.39 
 
 
728 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  60.7 
 
 
712 aa  846    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  60.11 
 
 
732 aa  844    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  58.47 
 
 
736 aa  848    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  54.26 
 
 
738 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  52.88 
 
 
740 aa  746    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  57.43 
 
 
775 aa  800    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  58.06 
 
 
736 aa  842    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  52.49 
 
 
728 aa  741    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  47.63 
 
 
746 aa  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  59.53 
 
 
741 aa  854    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  49.78 
 
 
765 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  53.51 
 
 
712 aa  741    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  49.68 
 
 
634 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  49.04 
 
 
729 aa  691    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  47.8 
 
 
741 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  58.87 
 
 
741 aa  837    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.94 
 
 
729 aa  775    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  54.5 
 
 
621 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  53.99 
 
 
749 aa  734    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  46.14 
 
 
755 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  59.07 
 
 
750 aa  816    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  53.6 
 
 
748 aa  731    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  54.44 
 
 
740 aa  741    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  54.39 
 
 
716 aa  740    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  56.45 
 
 
728 aa  777    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  47.35 
 
 
764 aa  690    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  54.26 
 
 
738 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  50.96 
 
 
749 aa  732    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  58.49 
 
 
743 aa  847    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  44.58 
 
 
754 aa  655    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  56.45 
 
 
728 aa  778    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  57.08 
 
 
735 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  48.78 
 
 
764 aa  694    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  48.31 
 
 
765 aa  693    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  55.89 
 
 
677 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.4 
 
 
1217 aa  664    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  47.74 
 
 
726 aa  694    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 
721 aa  1465    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  44.31 
 
 
754 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  49.33 
 
 
774 aa  711    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  52.56 
 
 
746 aa  728    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  52.89 
 
 
642 aa  638    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  54.1 
 
 
740 aa  787    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.46 
 
 
737 aa  702    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  55.85 
 
 
834 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  53.94 
 
 
812 aa  743    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  54.66 
 
 
716 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  53.62 
 
 
721 aa  731    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  56.24 
 
 
638 aa  693    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  54.6 
 
 
625 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  51.16 
 
 
729 aa  755    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  53.8 
 
 
716 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  51.72 
 
 
725 aa  712    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  58.92 
 
 
736 aa  841    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  54.98 
 
 
716 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  54.38 
 
 
716 aa  742    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  43.9 
 
 
754 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.69 
 
 
732 aa  694    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  56 
 
 
736 aa  778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  46.01 
 
 
755 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  48.28 
 
 
759 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  56.41 
 
 
722 aa  781    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  46.22 
 
 
729 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 
743 aa  690    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  55.79 
 
 
728 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  56.29 
 
 
738 aa  809    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  54.33 
 
 
725 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  49.37 
 
 
731 aa  662    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.99 
 
 
731 aa  646    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  54.92 
 
 
736 aa  733    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.14 
 
 
807 aa  739    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  45.49 
 
 
776 aa  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  47.35 
 
 
745 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  47.35 
 
 
745 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  53.86 
 
 
695 aa  690    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  45.47 
 
 
744 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  56.79 
 
 
733 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  60.39 
 
 
732 aa  849    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  48.56 
 
 
759 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  50.48 
 
 
1224 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  48.58 
 
 
756 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  56 
 
 
736 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  47.37 
 
 
745 aa  676    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 
743 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  53.58 
 
 
642 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  50 
 
 
723 aa  694    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  49.31 
 
 
728 aa  699    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  47.35 
 
 
745 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  51.24 
 
 
727 aa  711    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  54.98 
 
 
731 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  51.37 
 
 
749 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.35 
 
 
841 aa  703    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  45.18 
 
 
754 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  48.28 
 
 
759 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  47.62 
 
 
763 aa  694    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  47.74 
 
 
737 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.08 
 
 
631 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>