59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2908 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
401 aa  774    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  46.18 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  40.08 
 
 
867 aa  186  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  41.94 
 
 
404 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  35.67 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
392 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
3301 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 
545 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  33.42 
 
 
787 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
873 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 
774 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 
725 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  36.98 
 
 
1644 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  36.98 
 
 
1644 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
791 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  33.61 
 
 
916 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
856 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
671 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
389 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
1386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
1044 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
379 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
679 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
332 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  27.54 
 
 
1219 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
624 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
359 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.01 
 
 
616 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
1233 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  28.49 
 
 
1232 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  27.96 
 
 
394 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  28.94 
 
 
1364 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72020  hypothetical protein  31.17 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  26.26 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
345 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  26.75 
 
 
1635 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  24.88 
 
 
523 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
418 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
345 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.18 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  24.56 
 
 
759 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
382 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
995 aa  43.5  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  35.25 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  26.76 
 
 
542 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
384 aa  43.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.61 
 
 
420 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6257  putative glycosyltransferase  27.27 
 
 
484 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5679  hypothetical protein  26.14 
 
 
434 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
421 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>