68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2894 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  256  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  47.86 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  51.28 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  44.53 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3601  XRE family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000201761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1245  XRE family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.664422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 126 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  37.62 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  36.63 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4662  hypothetical protein  32.69 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700483  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  26.72 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 477 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 468 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 477 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 477 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  43.18 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  43.64 
 
 		 476 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  42.59 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  29.25 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4589  helix-turn-helix domain protein  38.18 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 253 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 69 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 69 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 69 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  39.22 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  36.73 
 
 		 216 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 474 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0253  hypothetical protein  29.82 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  30.51 
 
 		 493 aa  40.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  29.01 
 
 		 478 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 205 aa  40.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  34.67 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 220 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  42.5 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>