More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2844 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  100 
 
 		 411 aa  796    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  54.15 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  56.45 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  57.42 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  51.34 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  51.34 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  52.77 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  54.36 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  52.53 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  49.64 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  50.24 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  50 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  51.68 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  51.09 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  51.43 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  51.81 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  50.72 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  49.27 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  50 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  50.24 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  49.39 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  50.24 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  50.25 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  49.64 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  49.64 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  48.66 
 
 		 429 aa  359  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  47.86 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  48.05 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  45.76 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  47.93 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  51.54 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  48.55 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  38.73 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  34.84 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  41.58 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  35.05 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  41.98 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  34.9 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  37.77 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  42.04 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  38.06 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  42.06 
 
 		 410 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  39.9 
 
 		 424 aa  225  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  38.44 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  39.11 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  37.67 
 
 		 385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  43.16 
 
 		 422 aa  220  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  38.44 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  42.06 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  37.07 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  41.21 
 
 		 466 aa  219  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  41.49 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35.53 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  37.31 
 
 		 426 aa  216  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  41.05 
 
 		 415 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.01 
 
 		 407 aa  215  9e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  38.08 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  43.19 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  43.19 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  34.47 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  40.79 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  39.09 
 
 		 356 aa  213  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  34.73 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  41.62 
 
 		 419 aa  212  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  38.79 
 
 		 481 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  40.46 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  41 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  34.74 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 374 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 420 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.53 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  39.03 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  39.63 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  40.93 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  39.48 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  37.67 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  41.19 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.68 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  38.3 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  38.95 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  40.51 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  40.67 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  33.95 
 
 		 404 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  37.24 
 
 		 363 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  31.22 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  41.49 
 
 		 355 aa  199  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  32.84 
 
 		 444 aa  199  9e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  34.48 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.82 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 359 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  34.63 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  36.15 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  35.17 
 
 		 371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  35.99 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  38.57 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  37.85 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  38.24 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>