46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2703 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2703  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  344  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.600419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1096  Protein of unknown function DUF1790  72.46 
 
 		 167 aa  267  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.820328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  52.1 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4947  hypothetical protein  44.65 
 
 		 169 aa  160  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399738  hitchhiker  0.000000153474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2264  hypothetical protein  43.64 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1407  hypothetical protein  43.23 
 
 		 166 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.246502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0854  hypothetical protein  40.12 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4848  Protein of unknown function DUF1790  42.41 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  41.21 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1376  Protein of unknown function DUF1790  40.12 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  42.58 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4064  Protein of unknown function DUF1790  42.86 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3770  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4025  Protein of unknown function DUF1790  42.86 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.351333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3881  hypothetical protein  42.58 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.832488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2513  hypothetical protein  42.41 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1137  Protein of unknown function DUF1790  39.61 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3105  hypothetical protein  43.03 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4471  hypothetical protein  40.24 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.39855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1641  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2250  hypothetical protein  38.79 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2546  hypothetical protein  39.35 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1259  hypothetical protein  39.63 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00906465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3019  Protein of unknown function DUF1790  38.61 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2756  Protein of unknown function DUF1790  38.61 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1475  hypothetical protein  39.35 
 
 		 243 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1525  hypothetical protein  39.35 
 
 		 220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2148  hypothetical protein  37.42 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.8454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0676  hypothetical protein  41.56 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0763  hypothetical protein  42.51 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.396097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3169  hypothetical protein  37.34 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1141  hypothetical protein  38.56 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0039  hypothetical protein  39.47 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158376  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2199  hypothetical protein  37.66 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1322  hypothetical protein  36.36 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2646  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3330  hypothetical protein  37.01 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.635014  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0622  hypothetical protein  34.42 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3008  hypothetical protein  35.06 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3363  hypothetical protein  34.42 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0991  hypothetical protein  32.93 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0359037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1465  hypothetical protein  32.58 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344519  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0545  hypothetical protein  26.24 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0347  protein of unknown function DUF1790  24.32 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal  0.742766 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0169  hypothetical protein  24.32 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3255  hypothetical protein  24.62 
 
 		 153 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0701128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>