217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2662 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2662  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1049    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0513511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 572 aa  226  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 585 aa  217  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 612 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 595 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 622 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 617 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  29.68 
 
 		 593 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 592 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.52 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 633 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 631 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 617 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.42 
 
 		 619 aa  190  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  29.96 
 
 		 592 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 		 593 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 		 594 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 579 aa  181  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  28.91 
 
 		 583 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 621 aa  178  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  28.49 
 
 		 621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  28.2 
 
 		 621 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  30.87 
 
 		 677 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  35.74 
 
 		 425 aa  160  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.45 
 
 		 572 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 607 aa  151  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  26.47 
 
 		 619 aa  150  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 576 aa  144  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 610 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  33.22 
 
 		 584 aa  144  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.39 
 
 		 610 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  44.59 
 
 		 573 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 642 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 594 aa  117  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 571 aa  114  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  30.59 
 
 		 603 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.59 
 
 		 553 aa  87.4  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  27.76 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 607 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  30.33 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 613 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  24.81 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 607 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 607 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 607 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.74 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 638 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  28.38 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 594 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  29.82 
 
 		 520 aa  73.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 592 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  30.36 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  34.01 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 581 aa  71.2  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  28.12 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 722 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  35.4 
 
 		 595 aa  70.5  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  29.83 
 
 		 606 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  29.75 
 
 		 591 aa  70.1  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  31.85 
 
 		 635 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 567 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  30.54 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 568 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  31.76 
 
 		 575 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 573 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  34.51 
 
 		 551 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.93 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  26.32 
 
 		 575 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  28.44 
 
 		 573 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 584 aa  67  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.56 
 
 		 574 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 616 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  37.78 
 
 		 584 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 574 aa  66.6  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  32.8 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  32.82 
 
 		 573 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 572 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  26.8 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  34.4 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>