170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2661 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2661  ApaG  100 
 
 		 157 aa  322  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  62.39 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  55.28 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  52.42 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  54.62 
 
 		 127 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  50 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  53.28 
 
 		 130 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  53.28 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  54.03 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  53.45 
 
 		 130 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  52.59 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  53.72 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  51.24 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  50.83 
 
 		 237 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  52.14 
 
 		 130 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  52.59 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  52.46 
 
 		 211 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  51.64 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  53.45 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  51.24 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  53.45 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  50 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  46.56 
 
 		 130 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  49.59 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  50.41 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  44.72 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  50.82 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  45.53 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  49.59 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  52.03 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  43.9 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  45.8 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  50.43 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  46.56 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  45.8 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  45.8 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  48.7 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  49.57 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  49.58 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  45.8 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  47.97 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  50.43 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  50 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  51.28 
 
 		 127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  48.72 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  48.72 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  43.36 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  48.72 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  48.72 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  45.83 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  49.14 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  48.72 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  48.72 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  48.72 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  48.72 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  48.72 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  47.86 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  49.58 
 
 		 126 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  47.86 
 
 		 124 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  47.86 
 
 		 124 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  47.86 
 
 		 124 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  47.69 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  45.3 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  47.86 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  47.86 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  48.25 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  50 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  48.39 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  47.41 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  45.3 
 
 		 125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  50 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  45.83 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  46.22 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  51.4 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1050  ApaG  47.01 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  0.737772 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  45.83 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  45.3 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  42.02 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  45.3 
 
 		 125 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  50.47 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  50 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  50 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  45.83 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0270  ApaG  55.28 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  49.12 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  45.69 
 
 		 124 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  43.97 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  46.28 
 
 		 127 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  44.44 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  42.37 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>