More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2660 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  75.65 
 
 		 234 aa  310  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  73.37 
 
 		 205 aa  304  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  72.87 
 
 		 209 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  72.16 
 
 		 212 aa  297  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  73.51 
 
 		 212 aa  296  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 242 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 292 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 292 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 292 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  71.89 
 
 		 292 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 292 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  72.58 
 
 		 211 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  72.58 
 
 		 211 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 258 aa  294  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  72.58 
 
 		 209 aa  294  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  71.89 
 
 		 209 aa  294  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  72.58 
 
 		 211 aa  294  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 209 aa  294  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  72.58 
 
 		 210 aa  293  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  69.07 
 
 		 211 aa  290  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  70.83 
 
 		 206 aa  289  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  62.31 
 
 		 222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  66.31 
 
 		 203 aa  262  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  61.39 
 
 		 206 aa  262  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  65.08 
 
 		 203 aa  261  4e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  64.36 
 
 		 190 aa  256  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  64.02 
 
 		 203 aa  256  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  63.49 
 
 		 219 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  64.67 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  61.05 
 
 		 269 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  62.96 
 
 		 219 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  60.73 
 
 		 272 aa  251  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  65.19 
 
 		 197 aa  248  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  54.68 
 
 		 205 aa  247  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  64.64 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  60.2 
 
 		 204 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  58.21 
 
 		 213 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 		 222 aa  241  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  61.54 
 
 		 211 aa  238  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  54.73 
 
 		 213 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  56.54 
 
 		 213 aa  238  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  64.77 
 
 		 200 aa  237  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  55.45 
 
 		 242 aa  236  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  62.63 
 
 		 192 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  54.23 
 
 		 213 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  55.1 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  57.98 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  54.9 
 
 		 234 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  57.95 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  57.07 
 
 		 201 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  53.17 
 
 		 229 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 		 241 aa  231  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  56.61 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  57.75 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  50.51 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  58.24 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 		 204 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  54.12 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 		 190 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 247 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 239 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 239 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  51.81 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  48.76 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  52.08 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 184 aa  197  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  50.53 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  50.53 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  50.25 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  50.8 
 
 		 235 aa  194  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  49.01 
 
 		 209 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 226 aa  192  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  50.82 
 
 		 243 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  52.69 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  54.24 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  47.98 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  52.6 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  50.75 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  50.25 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  47.52 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>