More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2657 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 484 aa  956    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  62.98 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  57.99 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  59.84 
 
 		 233 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  55.88 
 
 		 258 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  57.36 
 
 		 257 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  48.05 
 
 		 276 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  55 
 
 		 257 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  54.41 
 
 		 253 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  53.96 
 
 		 254 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  54.89 
 
 		 254 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  48.3 
 
 		 310 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  53.62 
 
 		 242 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  50.37 
 
 		 301 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  54.07 
 
 		 268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  52.94 
 
 		 231 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  50.31 
 
 		 238 aa  139  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  51.97 
 
 		 210 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  51.8 
 
 		 238 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  50.37 
 
 		 265 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  51.85 
 
 		 272 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  51.52 
 
 		 241 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  52.21 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  50.77 
 
 		 251 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  50.37 
 
 		 261 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  51.49 
 
 		 240 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  50.37 
 
 		 336 aa  133  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  47.76 
 
 		 259 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  50.38 
 
 		 233 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  47.76 
 
 		 259 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  50.36 
 
 		 254 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  51.88 
 
 		 251 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  48.09 
 
 		 276 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  47.66 
 
 		 197 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 223 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 		 217 aa  123  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  45.18 
 
 		 242 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 262 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 		 234 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  48.39 
 
 		 120 aa  90.1  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  39.2 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2967  Lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.335517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.86 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  39.52 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  42.73 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.97 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  38.97 
 
 		 215 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 258 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  31.85 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  36.89 
 
 		 204 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  41.44 
 
 		 174 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  42.99 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  38.18 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  41.28 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  38.58 
 
 		 198 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  42.45 
 
 		 590 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  32.92 
 
 		 194 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  40.16 
 
 		 278 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  28.7 
 
 		 731 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  38.6 
 
 		 188 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  32.59 
 
 		 140 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.39 
 
 		 226 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  36.07 
 
 		 204 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  43.4 
 
 		 217 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1007  transglycosylase, putative  40.57 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 146 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 660 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  39.62 
 
 		 297 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 		 175 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  39.62 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  42.45 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  34.96 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  37.9 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.18 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  37.27 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1699  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  32.29 
 
 		 587 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0899262  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  37.27 
 
 		 239 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  37.27 
 
 		 239 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 		 251 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  41.11 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>