223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2628 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 386 aa  757    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  47.88 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  35.75 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  30.92 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  29.75 
 
 		 386 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  30.33 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  30.33 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  29.51 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  30.92 
 
 		 388 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  30 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  29.41 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  28.71 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  32.9 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  31.17 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  32.77 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  31.17 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  29.44 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  29.73 
 
 		 378 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  29.46 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  26.79 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  25 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  28.08 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  30.7 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 382 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  26.21 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  28.48 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  27.92 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.9 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  21.04 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  26.01 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 792 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.49 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  22.59 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  22.59 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  26.7 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  27.89 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  30.94 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  27.71 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  27.2 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  26.21 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  27.41 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  25.57 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  27.41 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  23.16 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  27.63 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  27.88 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  25.55 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  24.46 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  29.06 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0593  permease-like protein  25 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.472296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  23.22 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  26.89 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  23.86 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  24.09 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  26.43 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  26.67 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  26.68 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  23.25 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.68 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.54 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  23.15 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  26.81 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  22.84 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  23.66 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  26.38 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  24.05 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.18 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  23.66 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  24.05 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  23.66 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  24.05 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  23.66 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  23.66 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  23.66 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  23.66 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>