More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2413 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2413  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  766    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  58.61 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  63.66 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  58.76 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  52.55 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1634  HI0933-like protein  59.43 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0131276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  54.38 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  51.28 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  52.42 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  52.16 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  53.42 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  48.46 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  48.97 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  50.26 
 
 		 392 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  55.75 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  52.99 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  57.8 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  56.01 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  49.87 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  49.38 
 
 		 405 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  53.49 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  52.58 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  55.5 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  51.4 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  51.16 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  52.96 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  53.71 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  52.31 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  52.28 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  54.71 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  51.92 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  46.29 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  49.23 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  49.23 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  49.87 
 
 		 460 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  53.06 
 
 		 406 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  49.87 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  50.13 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  52.45 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  49.75 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  48.24 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  50 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  50.53 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  50.53 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  50 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  49.62 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  49.22 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  49.75 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  49.49 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  49.23 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  50.53 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  49.75 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  47.86 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  48 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  50 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  49.49 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  49.49 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  49.12 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  47.84 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  50.53 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  50.26 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  50 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  49.49 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  47.7 
 
 		 398 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  47.72 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  48.24 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  46.06 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  50.77 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  50.26 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  48.47 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  48.25 
 
 		 398 aa  364  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  46.04 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  51.94 
 
 		 416 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  50.5 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  50.5 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  50.5 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  50.5 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  50.5 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  50.5 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  50.5 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  47.44 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  44.95 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  44.39 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  47.3 
 
 		 415 aa  358  8e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  50.13 
 
 		 406 aa  358  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  47.41 
 
 		 413 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  47.44 
 
 		 398 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  47.44 
 
 		 398 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  47.44 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  48.49 
 
 		 405 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  43.87 
 
 		 438 aa  356  5e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  47.18 
 
 		 398 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  45.91 
 
 		 414 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  48.48 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  50.13 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  47.28 
 
 		 413 aa  352  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3115  FAD-dependent oxidoreductase of HI0933-like family protein  45.34 
 
 		 400 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  49.87 
 
 		 407 aa  352  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  48.46 
 
 		 400 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  48.46 
 
 		 400 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>