More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2405 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  100 
 
 		 217 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  51.08 
 
 		 209 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  47.42 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  47.42 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  46.56 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  47.96 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  48 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  47.6 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  46.19 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  42.36 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  48.1 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  42.78 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  42.92 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  45.36 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  42.92 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  44.62 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  39.62 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  42.58 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  42.13 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  42.93 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  43.52 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  41.51 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  44.22 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  40.4 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  41.09 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  41.98 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  41.38 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  41.38 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  38.92 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  39.6 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  39.8 
 
 		 277 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  41.79 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  41.97 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  40.51 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  39.02 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  43.46 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  42.25 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  40.62 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  40.41 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  42.86 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  38.64 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  39.77 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  35.33 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  39.39 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  36.61 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  38.99 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  36.67 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  41.88 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  45.65 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  39.13 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  38.29 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  40.37 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 234 aa  94.7  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  45.11 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  38.04 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  37.57 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  38.46 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  38.93 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  36.81 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  46.27 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  35.36 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2200  16S rRNA methyltransferase GidB  37.72 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  36.99 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  43.61 
 
 		 254 aa  91.7  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  38.51 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  40.49 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  40.12 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  40.12 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  34.48 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  37.14 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  36.57 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  41.14 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  35.98 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  44.44 
 
 		 262 aa  88.6  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  35.87 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  37.72 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  37.72 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  38.67 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  35.33 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  42.34 
 
 		 237 aa  88.2  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  42.42 
 
 		 228 aa  88.2  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  36.57 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  36.71 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  35.43 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  33.69 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  38.3 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  41.09 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  37.13 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  35.23 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  42.11 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  34.08 
 
 		 251 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  35.75 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  27.61 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>