More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2384 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  60.08 
 
 
514 aa  638    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  62.45 
 
 
506 aa  654    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  75.55 
 
 
504 aa  774    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  61.4 
 
 
505 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  64.27 
 
 
505 aa  651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  63.02 
 
 
505 aa  663    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  62.03 
 
 
505 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  65.93 
 
 
498 aa  677    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  63.87 
 
 
499 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  67.54 
 
 
501 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  80.16 
 
 
509 aa  818    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  64.53 
 
 
498 aa  661    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  65.46 
 
 
500 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  67.54 
 
 
499 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  64.47 
 
 
504 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  62.25 
 
 
499 aa  644    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  62.4 
 
 
504 aa  648    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  62.8 
 
 
504 aa  647    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  100 
 
 
499 aa  1022    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  81.96 
 
 
499 aa  813    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  63.4 
 
 
504 aa  648    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  68.14 
 
 
501 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  69.01 
 
 
501 aa  686    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  67.54 
 
 
501 aa  665    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  64.61 
 
 
503 aa  676    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  65.45 
 
 
496 aa  633  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  63.05 
 
 
510 aa  632  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  61.97 
 
 
497 aa  631  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  60.24 
 
 
505 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  62.2 
 
 
504 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  62.37 
 
 
499 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  62.47 
 
 
502 aa  619  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  58.63 
 
 
505 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  62.08 
 
 
510 aa  617  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  61.92 
 
 
503 aa  617  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  61.71 
 
 
507 aa  616  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  61.37 
 
 
500 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  61.01 
 
 
522 aa  606  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  59.24 
 
 
510 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  59.24 
 
 
510 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  59.44 
 
 
510 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  60.48 
 
 
507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  59.76 
 
 
517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  63.02 
 
 
506 aa  601  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  60.04 
 
 
505 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  60.44 
 
 
505 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  59.84 
 
 
505 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  60.48 
 
 
507 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  60.04 
 
 
505 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  59.24 
 
 
507 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  58.72 
 
 
505 aa  592  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  60.24 
 
 
505 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  59.15 
 
 
505 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  59.44 
 
 
505 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  59.05 
 
 
505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  56.54 
 
 
496 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  58.27 
 
 
514 aa  567  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.94 
 
 
496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.49 
 
 
497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  55.22 
 
 
499 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  55.22 
 
 
499 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.29 
 
 
498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  55.42 
 
 
505 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  55.02 
 
 
499 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  58.75 
 
 
502 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  55.02 
 
 
500 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  55.93 
 
 
509 aa  557  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  55.02 
 
 
503 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  55.02 
 
 
503 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  55.02 
 
 
500 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54.82 
 
 
500 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  54.82 
 
 
500 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  54.62 
 
 
500 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54.82 
 
 
500 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54.82 
 
 
500 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  55.02 
 
 
518 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  55.02 
 
 
518 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  55.02 
 
 
518 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  55.02 
 
 
518 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  55.02 
 
 
518 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  56.25 
 
 
501 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  54.2 
 
 
500 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  55.56 
 
 
494 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  54 
 
 
500 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  55.02 
 
 
500 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  54.22 
 
 
497 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  54.12 
 
 
502 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  54.11 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  55.71 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  53.53 
 
 
513 aa  539  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  54.12 
 
 
502 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  54.12 
 
 
502 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  53.72 
 
 
502 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  53.8 
 
 
497 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  54.12 
 
 
502 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  54.55 
 
 
496 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  54.12 
 
 
505 aa  535  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  53.01 
 
 
502 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  53.2 
 
 
499 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  53.15 
 
 
510 aa  535  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>