More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2269 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
414 aa  832  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.99 
 
 
415 aa  551  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  57.67 
 
 
422 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.62 
 
 
414 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  54.24 
 
 
413 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.84 
 
 
451 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.55 
 
 
418 aa  459  1e-128  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  53.81 
 
 
414 aa  459  1e-128  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.55 
 
 
418 aa  459  1e-128  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.83 
 
 
413 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.94 
 
 
429 aa  452  1e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.83 
 
 
413 aa  453  1e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.69 
 
 
429 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.12 
 
 
426 aa  448  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.19 
 
 
429 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.59 
 
 
408 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.07 
 
 
420 aa  448  1e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  52.1 
 
 
420 aa  447  1e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.4 
 
 
414 aa  445  1e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.86 
 
 
414 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.46 
 
 
415 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.93 
 
 
413 aa  441  1e-122  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.22 
 
 
428 aa  438  1e-122  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  52.2 
 
 
415 aa  441  1e-122  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.98 
 
 
414 aa  438  1e-122  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.28 
 
 
404 aa  439  1e-122  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.35 
 
 
429 aa  438  1e-122  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.98 
 
 
415 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.96 
 
 
421 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  50.98 
 
 
414 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
414 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  53.96 
 
 
424 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.39 
 
 
412 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.78 
 
 
408 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.2 
 
 
425 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.49 
 
 
415 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.36 
 
 
413 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.61 
 
 
413 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.59 
 
 
413 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  49.63 
 
 
414 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  50.99 
 
 
416 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.7 
 
 
412 aa  425  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  49.88 
 
 
405 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.57 
 
 
427 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  49.38 
 
 
414 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.15 
 
 
418 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.78 
 
 
416 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.48 
 
 
406 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  2.83455e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.19 
 
 
417 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  49.88 
 
 
405 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.92 
 
 
419 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.64 
 
 
413 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.48 
 
 
407 aa  418  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  49.88 
 
 
429 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.52 
 
 
416 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  47.15 
 
 
425 aa  417  1e-115  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  48.27 
 
 
419 aa  416  1e-115  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  45.06 
 
 
414 aa  416  1e-115  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.81 
 
 
414 aa  417  1e-115  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.48 
 
 
407 aa  417  1e-115  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.91 
 
 
421 aa  416  1e-115  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  7.71215e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53 
 
 
433 aa  416  1e-115  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.18 
 
 
419 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.49 
 
 
406 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 
662 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.03 
 
 
404 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.4 
 
 
414 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.49 
 
 
406 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  6.02764e-07 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.04 
 
 
418 aa  411  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.01 
 
 
419 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.76 
 
 
657 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.72 
 
 
406 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  7.97081e-10 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.72 
 
 
406 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04018e-08 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50 
 
 
406 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.54851e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.49 
 
 
406 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
412 aa  411  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.25 
 
 
406 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  1.07568e-08 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.16 
 
 
444 aa  408  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.25 
 
 
406 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  49.38 
 
 
604 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.91 
 
 
435 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  53 
 
 
429 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.44 
 
 
421 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.74 
 
 
406 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.1207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  47.03 
 
 
404 aa  410  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.49 
 
 
406 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  5.7861e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  49.38 
 
 
604 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  49.76 
 
 
421 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  50.49 
 
 
406 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.72 
 
 
406 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  50.49 
 
 
406 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 
417 aa  407  1e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.49 
 
 
406 aa  407  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.29 
 
 
415 aa  407  1e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.49 
 
 
406 aa  405  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  47.51 
 
 
626 aa  407  1e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.52 
 
 
408 aa  406  1e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.48 
 
 
406 aa  407  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  7.37026e-08 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.26 
 
 
417 aa  405  1e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.48 
 
 
406 aa  408  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>