More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2242 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  59.9 
 
 		 217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  65.48 
 
 		 215 aa  224  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  45.5 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  44.72 
 
 		 216 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 211 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 211 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  46.48 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  43.96 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  41.18 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  40.69 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  37.82 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  38.02 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  37.5 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  38.31 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>