More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2238 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  99.8 
 
 		 509 aa  988    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  100 
 
 		 504 aa  991    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  63.53 
 
 		 518 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  48.49 
 
 		 544 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  48.94 
 
 		 585 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  47.69 
 
 		 544 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  44.37 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  44.37 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  49.68 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  44.37 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  43.67 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  47.31 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.09 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 497 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  43.25 
 
 		 499 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.17 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.29 
 
 		 496 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.8 
 
 		 503 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  45.55 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  45.68 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.56 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  42.98 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  43.61 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  43.61 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  43.61 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  46.11 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.38 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  41.85 
 
 		 512 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  45.86 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.2 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.92 
 
 		 510 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.49 
 
 		 513 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  42.05 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  46.53 
 
 		 505 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  43.82 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.02 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 529 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.17 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  44.12 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.27 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  43.29 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.42 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  44.68 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.88 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  38.88 
 
 		 511 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.04 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  44.75 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 505 aa  382  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  44.33 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  40.17 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  46.25 
 
 		 505 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  43.32 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  42.83 
 
 		 526 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  41.96 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  40.4 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  43.93 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  36.92 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  44.68 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.18 
 
 		 520 aa  379  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  41.25 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  43.93 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  41.56 
 
 		 502 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  43.93 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.71 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  43.86 
 
 		 496 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.35 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  43.86 
 
 		 496 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.92 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  39 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.15 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.5 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.54 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  38.21 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  36.66 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  39 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  39.96 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  44.7 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  46.84 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  43.86 
 
 		 496 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  37.94 
 
 		 515 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  39.24 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.15 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  38.55 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>