90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2110 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  100 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.82 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.86 
 
 
199 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.2 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.63 
 
 
195 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.36 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.06 
 
 
198 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297316  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.35 
 
 
200 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.780711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0095  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.92 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.08 
 
 
198 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.16 
 
 
210 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.46 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0745  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.16 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.11 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.51 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000362889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.89 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.57 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.57 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4023  putative pyridoxamine-phosphate oxidase  32.97 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.323622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.43 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  29.45 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.17 
 
 
184 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1580  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.1 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0367191  normal  0.0444647 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  26.75 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  27.08 
 
 
180 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  27.4 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.12 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0364941 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15191  hypothetical protein  26 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.98 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  27.06 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  27.88 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.93 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.75 
 
 
194 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.97 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.94 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.63 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.1 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.1 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.867273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.85 
 
 
184 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.07 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.26 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1026  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.72 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.392091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4813  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.71 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  0.171584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  21.82 
 
 
197 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.51 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.51 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4754  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.84 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.1157  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30330  pyridoxamine-phosphate oxidase  33.63 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1789  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00011634  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.46 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00869837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.04 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0531  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.79 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.35 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0363  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.3 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1389  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.89 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0048  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.85 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892754  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.5 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.56 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.932005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.81 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069325  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4664  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.07 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4295  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.07 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01800  hypothetical protein  36.92 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853891  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0678  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.89 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.21 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.91 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2475  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.18 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102902  normal  0.0239297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0724  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.66 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.87 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1052  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.85 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0070  hypothetical protein  28.87 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.16 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.77 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.61 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0394  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.47 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.21 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1988  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.7 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  normal  0.0355751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2818  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  29.17 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.647685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0858  pyridoxamine-phosphate oxidase  31.18 
 
 
220 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911658  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1205  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.89 
 
 
212 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.77 
 
 
218 aa  41.6  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1108  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.43 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.536628  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.18 
 
 
225 aa  41.6  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.46 
 
 
213 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318337  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1159  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.08 
 
 
216 aa  41.6  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0654  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.62 
 
 
216 aa  41.6  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.273077  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.43 
 
 
217 aa  41.6  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.18 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 
214 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>