More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2089 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  904    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  38.89 
 
 
452 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  39.26 
 
 
449 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  38.43 
 
 
449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  38.82 
 
 
438 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  38.56 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  38.56 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  38.56 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  39.52 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  38.56 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  38.56 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  38.56 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  38.3 
 
 
440 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  38.3 
 
 
437 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  36.25 
 
 
443 aa  256  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  35.36 
 
 
460 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  38.86 
 
 
511 aa  246  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.24 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  37.41 
 
 
453 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  31.14 
 
 
429 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  32.5 
 
 
430 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  33.42 
 
 
413 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  36.83 
 
 
460 aa  227  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  32.09 
 
 
415 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  33.51 
 
 
406 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  33.99 
 
 
431 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  33.76 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  34.28 
 
 
436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  38.05 
 
 
487 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  30.88 
 
 
447 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  33.41 
 
 
438 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  31.83 
 
 
432 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  32.5 
 
 
443 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  31.39 
 
 
469 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  33.16 
 
 
433 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  33.16 
 
 
433 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  34.28 
 
 
434 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  32.9 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  32.38 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  31.99 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  31.99 
 
 
421 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  31.99 
 
 
421 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  31.99 
 
 
421 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  31.74 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  31.74 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  31.41 
 
 
429 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  31.74 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.85 
 
 
494 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  33.48 
 
 
463 aa  189  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  31.35 
 
 
434 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  31.09 
 
 
434 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  31.35 
 
 
434 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  31.35 
 
 
434 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  38.46 
 
 
293 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  35.66 
 
 
489 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  32.9 
 
 
493 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  36.82 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  36.82 
 
 
289 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  29.56 
 
 
414 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  36.65 
 
 
291 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  36.2 
 
 
291 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 
453 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  34.24 
 
 
453 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  28.46 
 
 
458 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  37.5 
 
 
290 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  28.46 
 
 
458 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  29.8 
 
 
410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  36.87 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  28.1 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  31 
 
 
282 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.17 
 
 
404 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  28.03 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  30.07 
 
 
282 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  29 
 
 
552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  29 
 
 
571 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  29 
 
 
552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  30.51 
 
 
282 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  29.46 
 
 
594 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  31.2 
 
 
289 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  28.75 
 
 
560 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  28.75 
 
 
552 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  28.75 
 
 
552 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  28.75 
 
 
571 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  27.44 
 
 
536 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  30.19 
 
 
290 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  31.22 
 
 
289 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  30.04 
 
 
289 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  26.92 
 
 
536 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  31.71 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.17 
 
 
258 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  26.92 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  30.88 
 
 
278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  28.9 
 
 
261 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.78 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  32.08 
 
 
257 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.84 
 
 
258 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  32.08 
 
 
257 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  29.34 
 
 
271 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.46 
 
 
327 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  30.67 
 
 
258 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>