165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2088 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  36.6 
 
 		 1220 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  39.28 
 
 		 1102 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  37.86 
 
 		 1171 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  100 
 
 		 1175 aa  2328    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  38.29 
 
 		 1176 aa  743    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  34.55 
 
 		 1199 aa  628  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  34.88 
 
 		 1181 aa  625  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  35.46 
 
 		 1211 aa  608  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  30.6 
 
 		 1172 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  39.48 
 
 		 1204 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  33.5 
 
 		 1164 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  33.69 
 
 		 1208 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  30.5 
 
 		 1182 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 1209 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  34.18 
 
 		 1218 aa  572  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  33.41 
 
 		 1209 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  33.42 
 
 		 1209 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 1209 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 1209 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  33.41 
 
 		 1209 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  33.41 
 
 		 1209 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  33.33 
 
 		 1209 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  33.06 
 
 		 1209 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  35.56 
 
 		 1148 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1205 aa  558  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  30.46 
 
 		 1212 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1181 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1173 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  33.94 
 
 		 1173 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  33.97 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  30.88 
 
 		 1207 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  32.72 
 
 		 1157 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  33.64 
 
 		 1152 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  31.23 
 
 		 1302 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  31.15 
 
 		 1302 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  31.15 
 
 		 1302 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  31.23 
 
 		 1179 aa  453  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  30.06 
 
 		 1302 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  30.11 
 
 		 1302 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  30.84 
 
 		 1302 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1179 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  29.99 
 
 		 1329 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1192 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  28.59 
 
 		 1268 aa  422  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1175 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1175 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  30.03 
 
 		 1289 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  28.43 
 
 		 1348 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  30.03 
 
 		 1289 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  30.03 
 
 		 1289 aa  396  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  29.95 
 
 		 1289 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1168 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1332 aa  365  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  29.38 
 
 		 1358 aa  354  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  28.75 
 
 		 1317 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  29.38 
 
 		 1358 aa  352  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25.8 
 
 		 1182 aa  350  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  29.14 
 
 		 1358 aa  343  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1369 aa  341  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1195 aa  340  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  29.4 
 
 		 1365 aa  333  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  28.68 
 
 		 1365 aa  333  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  24.15 
 
 		 1187 aa  332  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 1194 aa  322  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  26.14 
 
 		 1165 aa  312  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1208 aa  309  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1008 aa  305  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  26.01 
 
 		 1165 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  28.43 
 
 		 1366 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  26.15 
 
 		 1177 aa  301  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  26.15 
 
 		 1177 aa  301  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  26.28 
 
 		 1288 aa  300  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1275 aa  298  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  25.02 
 
 		 1275 aa  298  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  25.37 
 
 		 1165 aa  298  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  26 
 
 		 1230 aa  288  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  25.59 
 
 		 1206 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1206 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  25.96 
 
 		 1153 aa  274  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1153 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.02 
 
 		 1194 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1270 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1174 aa  258  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1174 aa  258  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  25.05 
 
 		 1150 aa  249  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  25.93 
 
 		 1205 aa  242  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  34.36 
 
 		 1313 aa  235  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  24.92 
 
 		 1164 aa  222  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1315 aa  221  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  31.76 
 
 		 890 aa  219  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  31.76 
 
 		 890 aa  219  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  32.27 
 
 		 1314 aa  218  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  32.27 
 
 		 1314 aa  217  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  32.27 
 
 		 1314 aa  217  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1297 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  36.73 
 
 		 1301 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1297 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1297 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1297 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1297 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>