21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2085 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2085  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  355  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.839519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  31.77 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  32.24 
 
 
212 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  28.5 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  29.34 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  30.99 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  26.94 
 
 
207 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.49 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  30.65 
 
 
204 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  26.42 
 
 
191 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  26.4 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  25.35 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  27.86 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  26.4 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  28.48 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  25.23 
 
 
197 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  28.12 
 
 
212 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  32.41 
 
 
242 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  30.48 
 
 
192 aa  41.2  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  27.32 
 
 
237 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>