More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2068 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  100 
 
 
432 aa  867    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  40.05 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 
444 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 
444 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 
444 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  41.38 
 
 
443 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  41.26 
 
 
430 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  41.03 
 
 
430 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  41.26 
 
 
430 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  41.26 
 
 
430 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  41.26 
 
 
430 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  40.79 
 
 
430 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 
433 aa  272  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  36.88 
 
 
438 aa  269  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  36.18 
 
 
435 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  36.28 
 
 
431 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  36.88 
 
 
438 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  31.46 
 
 
429 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
431 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 
432 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  34.19 
 
 
432 aa  225  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  32.69 
 
 
424 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  30.96 
 
 
432 aa  222  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  32.7 
 
 
453 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  32.4 
 
 
426 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  31.62 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  31.62 
 
 
426 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.24 
 
 
429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  33.5 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
426 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  33.42 
 
 
444 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
426 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  31.3 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  33.42 
 
 
435 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  31.88 
 
 
432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  33.67 
 
 
430 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  33.51 
 
 
435 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  32.94 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  33.67 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  32.94 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  32.94 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  32.94 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  31.62 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  33.67 
 
 
430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  31.26 
 
 
426 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  31.62 
 
 
426 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  31.62 
 
 
426 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  31.85 
 
 
426 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  31.75 
 
 
425 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  29.52 
 
 
436 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  31.37 
 
 
430 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  31.99 
 
 
433 aa  207  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
424 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  31.37 
 
 
443 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  29.38 
 
 
437 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  27.9 
 
 
441 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  32.35 
 
 
426 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
440 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  27.9 
 
 
441 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  28.64 
 
 
434 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
444 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  30.37 
 
 
440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
441 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  33.65 
 
 
440 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  28.95 
 
 
437 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  29.1 
 
 
436 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  28.86 
 
 
441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  29.41 
 
 
442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  29.47 
 
 
441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  29.43 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  28.87 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  28.87 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  28.87 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  29.43 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  30.77 
 
 
451 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  29.11 
 
 
434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  29.43 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  27.48 
 
 
443 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  28.92 
 
 
439 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  29.43 
 
 
441 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  29.43 
 
 
441 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  29.17 
 
 
441 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  29.76 
 
 
441 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  32.94 
 
 
435 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  29.06 
 
 
436 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  29.06 
 
 
436 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  32.38 
 
 
443 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  28.87 
 
 
434 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  31.65 
 
 
446 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  29.06 
 
 
436 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  29.23 
 
 
442 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  31.65 
 
 
446 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  28.97 
 
 
445 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  29.81 
 
 
441 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
440 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>