More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2066 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  62.16 
 
 
154 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  52.38 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  52.38 
 
 
153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  51.7 
 
 
153 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  53.15 
 
 
154 aa  155  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  54.55 
 
 
153 aa  155  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 
157 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 
168 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
162 aa  141  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  53.73 
 
 
147 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 
158 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
175 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  51.41 
 
 
153 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
175 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
162 aa  136  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  51.41 
 
 
153 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
202 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 
161 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 
156 aa  133  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  46.15 
 
 
175 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  46.15 
 
 
175 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  46.15 
 
 
175 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  45.89 
 
 
229 aa  133  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  46.15 
 
 
175 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  45.89 
 
 
229 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  48.25 
 
 
161 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
175 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
161 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 
156 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  41.96 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
162 aa  130  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 
174 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  46.76 
 
 
213 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  42.86 
 
 
159 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
154 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
154 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
161 aa  127  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 
153 aa  127  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  43.36 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  41.89 
 
 
166 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
176 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  43.36 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  43.36 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  43.36 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  38.78 
 
 
156 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 
154 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
169 aa  124  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  43.54 
 
 
172 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 
149 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 
154 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
156 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  43.66 
 
 
152 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.1 
 
 
156 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
160 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
156 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
153 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
166 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
164 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
166 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
166 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
157 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
156 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
156 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
152 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
152 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
154 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
152 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
152 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
177 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 
165 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 
154 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 
154 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
158 aa  120  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  41.67 
 
 
155 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
156 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
166 aa  120  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>