More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1978 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
416 aa  848  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  53.7 
 
 
414 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  51.95 
 
 
446 aa  405  1e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  52.38 
 
 
407 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  53.65 
 
 
412 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  48.92 
 
 
405 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  48.92 
 
 
405 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  47.55 
 
 
406 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  49.09 
 
 
402 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  50.26 
 
 
417 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  46.62 
 
 
410 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  47.64 
 
 
401 aa  364  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  49.26 
 
 
401 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  48.76 
 
 
403 aa  362  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  47.28 
 
 
403 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.22 
 
 
400 aa  358  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  47.12 
 
 
402 aa  357  2e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.04 
 
 
406 aa  355  6e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  48.56 
 
 
402 aa  349  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.1 
 
 
408 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  42.61 
 
 
414 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  51.57 
 
 
379 aa  327  2e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  44.12 
 
 
426 aa  303  4e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  40.88 
 
 
412 aa  299  5e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  42.22 
 
 
434 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  33.16 
 
 
410 aa  201  1e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  34.99 
 
 
369 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  32.4 
 
 
451 aa  185  2e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  34.12 
 
 
372 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  32.19 
 
 
420 aa  181  3e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  33.24 
 
 
369 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  33.04 
 
 
369 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  35.85 
 
 
361 aa  176  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.48 
 
 
411 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.38 
 
 
417 aa  173  4e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  35.96 
 
 
414 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  32.73 
 
 
461 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  32.5 
 
 
461 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  35.8 
 
 
417 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.62 
 
 
370 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.91 
 
 
369 aa  165  1e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.81 
 
 
406 aa  164  2e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.87 
 
 
453 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  31.73 
 
 
408 aa  164  4e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.52 
 
 
412 aa  163  6e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.52 
 
 
412 aa  163  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.78 
 
 
416 aa  162  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.07 
 
 
409 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  28.19 
 
 
457 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  31.16 
 
 
408 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35 
 
 
376 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.86 
 
 
415 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.04 
 
 
400 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.48 
 
 
363 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.16 
 
 
408 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.97 
 
 
408 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.38 
 
 
408 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.99 
 
 
367 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.91 
 
 
409 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.7 
 
 
359 aa  147  4e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  29.38 
 
 
408 aa  147  4e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  33.24 
 
 
407 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  33.53 
 
 
407 aa  142  1e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  29.88 
 
 
409 aa  140  4e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  33.54 
 
 
420 aa  136  7e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.25 
 
 
405 aa  135  1e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  32.27 
 
 
425 aa  132  8e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  32.42 
 
 
431 aa  132  1e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.89 
 
 
415 aa  132  1e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  29.3 
 
 
380 aa  131  2e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  32.42 
 
 
427 aa  129  8e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 
425 aa  129  1e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  31.21 
 
 
425 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  33.64 
 
 
440 aa  126  8e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  31.14 
 
 
866 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  30.9 
 
 
349 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 
430 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  31.53 
 
 
423 aa  120  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.62 
 
 
501 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  32 
 
 
418 aa  119  1e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  32 
 
 
418 aa  119  1e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  30.94 
 
 
418 aa  116  8e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  30.26 
 
 
457 aa  116  9e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  31.03 
 
 
457 aa  115  1e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.57 
 
 
430 aa  115  1e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
338 aa  114  4e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  31.36 
 
 
428 aa  114  4e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  31.36 
 
 
428 aa  114  4e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  31.87 
 
 
448 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.21 
 
 
335 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  26.92 
 
 
453 aa  113  8e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  30.32 
 
 
449 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  30.87 
 
 
445 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  31.43 
 
 
406 aa  109  7e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  29.23 
 
 
431 aa  109  7e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  30.32 
 
 
451 aa  109  8e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.81 
 
 
415 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  31.1 
 
 
424 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.11 
 
 
402 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  26.4 
 
 
1016 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>