More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1961 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 354 aa  667    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.76 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.77 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.52 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.94 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.94 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.31 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.87 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 		 362 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.97 
 
 		 352 aa  288  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.44 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.99 
 
 		 357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.4 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.58 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  47.62 
 
 		 384 aa  285  7e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.28 
 
 		 363 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.84 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  49 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.7 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.4 
 
 		 364 aa  279  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  51.14 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  44.64 
 
 		 348 aa  276  6e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.29 
 
 		 358 aa  275  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.59 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.49 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.22 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 358 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  51.44 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.6 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.96 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.6 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  45.82 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.64 
 
 		 355 aa  264  1e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.69 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  47.88 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.32 
 
 		 364 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.28 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.14 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.16 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.39 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.75 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.79 
 
 		 350 aa  258  9e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  46.13 
 
 		 363 aa  256  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  50.84 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.04 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  48.42 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.74 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  44.96 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  41.54 
 
 		 339 aa  245  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.59 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  44.14 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  40.44 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  43.98 
 
 		 356 aa  242  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 393 aa  242  9e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  46.22 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  43.71 
 
 		 377 aa  241  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  43.62 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.31 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  45.58 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.51 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.37 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.15 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.37 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.94 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.4 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.97 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.72 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.08 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.99 
 
 		 348 aa  236  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  45.05 
 
 		 375 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  43.47 
 
 		 355 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  42.11 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.25 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  46.8 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.68 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.68 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.71 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.81 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.3 
 
 		 389 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.92 
 
 		 353 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.43 
 
 		 356 aa  232  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.36 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  45.56 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>