More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1959 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 466 aa  940    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  57.33 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 471 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 475 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 473 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 		 474 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 473 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 474 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 474 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 474 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 496 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 474 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 491 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 474 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 490 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 465 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 471 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 466 aa  425  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 466 aa  425  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 467 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 466 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 471 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  45.34 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 471 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 472 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 473 aa  392  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 469 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>