More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1926 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
449 aa  894  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  70 
 
 
448 aa  643  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  66.89 
 
 
447 aa  612  1e-174  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  66.22 
 
 
444 aa  612  1e-174  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  65.48 
 
 
443 aa  611  1e-174  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  65.48 
 
 
443 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  65.92 
 
 
443 aa  603  1e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  64.72 
 
 
443 aa  599  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  65.03 
 
 
443 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  65.7 
 
 
443 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  65.78 
 
 
445 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  65.26 
 
 
443 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  66.37 
 
 
448 aa  591  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  63.94 
 
 
446 aa  588  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  63.94 
 
 
446 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  65.33 
 
 
444 aa  589  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.20552e-06 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  64.16 
 
 
446 aa  585  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  65.11 
 
 
445 aa  584  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  63.23 
 
 
446 aa  584  1e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  63.25 
 
 
442 aa  579  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  65.64 
 
 
447 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  63.56 
 
 
444 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  65.42 
 
 
447 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  65.42 
 
 
447 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  63.27 
 
 
446 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  61.02 
 
 
448 aa  564  1e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  63.27 
 
 
446 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  64.16 
 
 
446 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  62.61 
 
 
446 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  58.61 
 
 
452 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  60.38 
 
 
443 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  2.66535e-11 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  58.31 
 
 
455 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  60.38 
 
 
443 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  60.09 
 
 
437 aa  511  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  59.33 
 
 
453 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  58.16 
 
 
442 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.52006e-07  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1775  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  58.06 
 
 
446 aa  506  1e-142  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152379  normal  0.149147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  58.19 
 
 
457 aa  506  1e-142  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  58.45 
 
 
440 aa  504  1e-142  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  7.06243e-08 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  56.76 
 
 
452 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  56.98 
 
 
452 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  55.26 
 
 
455 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2798  preprotein translocase subunit SecY  56.32 
 
 
457 aa  491  1e-138  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  59.91 
 
 
440 aa  488  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  6.31755e-08  hitchhiker  3.21163e-06 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  57.34 
 
 
442 aa  491  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  57.27 
 
 
454 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  56.95 
 
 
453 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  57.48 
 
 
441 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  55.46 
 
 
456 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  57.65 
 
 
452 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  57.51 
 
 
448 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  55.35 
 
 
440 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  56.5 
 
 
436 aa  470  1e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  55.36 
 
 
436 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  55.12 
 
 
439 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  52.19 
 
 
434 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  54.95 
 
 
441 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  55.04 
 
 
443 aa  460  1e-128  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  53.69 
 
 
439 aa  460  1e-128  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  54.28 
 
 
439 aa  461  1e-128  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  53.69 
 
 
439 aa  460  1e-128  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  53.97 
 
 
437 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  54.14 
 
 
439 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  55.75 
 
 
437 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  53.62 
 
 
436 aa  452  1e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  52.56 
 
 
439 aa  453  1e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  54.71 
 
 
447 aa  452  1e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  52.83 
 
 
446 aa  454  1e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.81445e-07  unclonable  1.05897e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  51.96 
 
 
435 aa  454  1e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  54.24 
 
 
435 aa  454  1e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  54.35 
 
 
437 aa  452  1e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0334  preprotein translocase subunit SecY  57.27 
 
 
448 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507904  decreased coverage  0.00438746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  51.95 
 
 
435 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  8.11889e-07 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  52.87 
 
 
437 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2819  preprotein translocase subunit SecY  57.14 
 
 
448 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.83211  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3624  preprotein translocase subunit SecY  57.27 
 
 
448 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0024204  hitchhiker  3.16341e-11 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  52.59 
 
 
446 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.14541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  54.48 
 
 
447 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  52.59 
 
 
446 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.08952e-07  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  53.13 
 
 
443 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3048  preprotein translocase subunit SecY  56.81 
 
 
448 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  52.42 
 
 
444 aa  448  1e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.17062e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  51.49 
 
 
443 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  52.86 
 
 
454 aa  446  1e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2304  preprotein translocase subunit SecY  55.71 
 
 
451 aa  445  1e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  52.31 
 
 
429 aa  447  1e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  52.12 
 
 
446 aa  446  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.09869e-07  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  52.12 
 
 
446 aa  446  1e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.58427e-07  unclonable  8.37901e-11 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  51.49 
 
 
443 aa  445  1e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  51.49 
 
 
443 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  52.12 
 
 
446 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  6.05107e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3784  preprotein translocase subunit SecY  56.81 
 
 
448 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  52.36 
 
 
446 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  7.98254e-06  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  52.61 
 
 
442 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3726  preprotein translocase subunit SecY  56.81 
 
 
448 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0105177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  52.36 
 
 
446 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.58721e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3149  preprotein translocase subunit SecY  56.81 
 
 
448 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0275585  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1944  preprotein translocase subunit SecY  56.81 
 
 
448 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0269  preprotein translocase subunit SecY  57.14 
 
 
449 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432413  normal  0.0196675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  51.96 
 
 
444 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>