More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1896 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
591 aa  1143    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.75 
 
 
593 aa  418  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  32.19 
 
 
831 aa  253  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.66 
 
 
961 aa  237  6e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.71 
 
 
1402 aa  230  4e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.45 
 
 
684 aa  228  3e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.34 
 
 
685 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 
557 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.75 
 
 
489 aa  207  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
1032 aa  194  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.95 
 
 
490 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.54 
 
 
789 aa  192  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.53 
 
 
1493 aa  190  8e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  29.95 
 
 
490 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.29 
 
 
528 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  27.89 
 
 
1037 aa  171  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.73 
 
 
393 aa  170  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.99 
 
 
680 aa  166  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.46 
 
 
341 aa  163  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  29.64 
 
 
425 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
448 aa  151  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.16 
 
 
865 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.05 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  27.22 
 
 
1877 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.7 
 
 
505 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
976 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.22 
 
 
343 aa  144  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  29.78 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.95 
 
 
376 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.36 
 
 
376 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  33.75 
 
 
380 aa  133  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.62 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.52 
 
 
380 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.14 
 
 
305 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 
509 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.9 
 
 
318 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.32 
 
 
509 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3565  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.29 
 
 
418 aa  127  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.32 
 
 
509 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.52 
 
 
342 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.07 
 
 
509 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.17 
 
 
392 aa  123  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.89 
 
 
487 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  27.46 
 
 
373 aa  121  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30.12 
 
 
267 aa  120  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.79 
 
 
512 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.46 
 
 
373 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  30.75 
 
 
961 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.19 
 
 
1002 aa  117  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  29.65 
 
 
327 aa  117  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  34.56 
 
 
415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.94 
 
 
256 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.31 
 
 
255 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.78 
 
 
416 aa  115  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  35.75 
 
 
245 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  25.92 
 
 
1366 aa  114  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.82 
 
 
890 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 
346 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.9 
 
 
232 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.93 
 
 
2413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1438  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.09 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.636598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 
303 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.33 
 
 
271 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  34.77 
 
 
358 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.14 
 
 
552 aa  107  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  35.44 
 
 
478 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.42 
 
 
331 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  32.18 
 
 
367 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  31.14 
 
 
285 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
252 aa  106  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  24.02 
 
 
1078 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.01 
 
 
235 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.57 
 
 
838 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  25.56 
 
 
331 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.47 
 
 
523 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  25.56 
 
 
331 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  24.02 
 
 
1044 aa  104  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.23 
 
 
565 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  25.78 
 
 
1200 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  27.02 
 
 
331 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  26.15 
 
 
850 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.82 
 
 
270 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.02 
 
 
278 aa  101  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  25.56 
 
 
1200 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  25.76 
 
 
482 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.41 
 
 
208 aa  99.8  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  35.55 
 
 
337 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.05 
 
 
225 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 
1430 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.45 
 
 
231 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.38 
 
 
971 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 
316 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  28.45 
 
 
293 aa  97.4  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  29.8 
 
 
329 aa  97.4  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.66 
 
 
325 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  27.66 
 
 
325 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.21 
 
 
322 aa  96.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.93 
 
 
798 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  30.31 
 
 
325 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>