More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1822 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 576 aa  1168    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  57.5 
 
 		 549 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  56.99 
 
 		 578 aa  626  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  56.17 
 
 		 569 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  52.13 
 
 		 578 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  52.72 
 
 		 551 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  56.12 
 
 		 597 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  54.04 
 
 		 552 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  53.21 
 
 		 662 aa  592  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  52.45 
 
 		 584 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  55.11 
 
 		 601 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  54.62 
 
 		 564 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  51.31 
 
 		 562 aa  538  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  51.74 
 
 		 565 aa  531  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  49.48 
 
 		 558 aa  521  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  51.8 
 
 		 549 aa  507  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  40.14 
 
 		 537 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  61.31 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  39.27 
 
 		 541 aa  353  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  37.94 
 
 		 558 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 540 aa  316  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  37.41 
 
 		 542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  37.22 
 
 		 542 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  35.26 
 
 		 539 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  66.05 
 
 		 277 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  68 
 
 		 251 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  36.77 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  34.8 
 
 		 520 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  33.4 
 
 		 564 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  33.71 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  31.23 
 
 		 564 aa  174  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.69 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  29.94 
 
 		 626 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.67 
 
 		 546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.79 
 
 		 515 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  31.06 
 
 		 738 aa  136  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.52 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  27.22 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.54 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.54 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.03 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.88 
 
 		 510 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.79 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.59 
 
 		 415 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.79 
 
 		 484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 		 517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.14 
 
 		 522 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.39 
 
 		 479 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.34 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  22.1 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.5 
 
 		 515 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.17 
 
 		 563 aa  110  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.02 
 
 		 539 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1112  hypothetical protein  46.51 
 
 		 170 aa  108  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.5 
 
 		 521 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  31.16 
 
 		 279 aa  107  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.58 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  26.08 
 
 		 707 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  30.71 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.84 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.39 
 
 		 554 aa  104  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24 
 
 		 542 aa  103  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.38 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  24.94 
 
 		 552 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  28.37 
 
 		 540 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.68 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.98 
 
 		 465 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  20.14 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  23.52 
 
 		 561 aa  95.9  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  23.37 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  22.49 
 
 		 500 aa  94.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.21 
 
 		 553 aa  94.7  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.71 
 
 		 522 aa  94.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.43 
 
 		 522 aa  94  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  30.64 
 
 		 459 aa  92.8  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.34 
 
 		 509 aa  92  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  27.15 
 
 		 678 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25 
 
 		 429 aa  90.9  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  24.41 
 
 		 551 aa  90.9  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  26.77 
 
 		 707 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  28.16 
 
 		 476 aa  90.5  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  22.12 
 
 		 488 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  30.84 
 
 		 343 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.49 
 
 		 505 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  22.44 
 
 		 606 aa  89  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  22.44 
 
 		 606 aa  89  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  25.91 
 
 		 641 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  29.47 
 
 		 462 aa  87.8  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  25.41 
 
 		 552 aa  87.4  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  23.4 
 
 		 519 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  26.57 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.43 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  29.8 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  24.69 
 
 		 862 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  30.58 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  29.41 
 
 		 568 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  23.8 
 
 		 555 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>