66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1763 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  100 
 
 
516 aa  1016    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  46.64 
 
 
499 aa  243  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  45.57 
 
 
594 aa  229  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  46.54 
 
 
1050 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  46.74 
 
 
460 aa  202  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  39.14 
 
 
493 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  40.72 
 
 
738 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  39.58 
 
 
447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  39.08 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  51.61 
 
 
465 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  39.16 
 
 
465 aa  170  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  48.63 
 
 
743 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  51.16 
 
 
452 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  43.86 
 
 
418 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  38.51 
 
 
1503 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  47.51 
 
 
283 aa  158  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  50.83 
 
 
848 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  34.69 
 
 
644 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  55.78 
 
 
363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  37.62 
 
 
308 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  44.39 
 
 
346 aa  143  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  45.03 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  43.88 
 
 
342 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  44.83 
 
 
641 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  41.83 
 
 
346 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  42.58 
 
 
273 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  42.86 
 
 
292 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  40.54 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  40.54 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  38.78 
 
 
792 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  39.35 
 
 
212 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  42.66 
 
 
353 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  40.28 
 
 
833 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 
561 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  40.94 
 
 
425 aa  100  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  37.28 
 
 
1462 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  45.07 
 
 
352 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  34.42 
 
 
589 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  38.89 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  39.33 
 
 
322 aa  91.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  42.36 
 
 
319 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  35 
 
 
220 aa  90.9  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  38.71 
 
 
232 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  36.06 
 
 
340 aa  87.4  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  39.04 
 
 
369 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  40.29 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  35.23 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  40.14 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  40.41 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 
1043 aa  82.4  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  38.62 
 
 
338 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  40.4 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  34.25 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35.04 
 
 
950 aa  76.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  35.83 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  29.9 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  36.24 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  34.03 
 
 
526 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  35.42 
 
 
477 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  32.21 
 
 
767 aa  67.4  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  34.46 
 
 
854 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  33.78 
 
 
332 aa  60.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  56.36 
 
 
190 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1159  hypothetical protein  41.98 
 
 
172 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  32.12 
 
 
348 aa  47.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  32.91 
 
 
197 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>