More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1689 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 268 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  63.81 
 
 		 276 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  58.14 
 
 		 274 aa  268  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  58.14 
 
 		 274 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  61.48 
 
 		 266 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  49.06 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  51.55 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  46.36 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  42.32 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  49.81 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  47.1 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  46.77 
 
 		 291 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  47.15 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  44.53 
 
 		 274 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  47.74 
 
 		 275 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  51.38 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  52.11 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  48.13 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  43.8 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  46.79 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  50.37 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  48.5 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  48.5 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  41.79 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  45 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  50.39 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  38.81 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  47.74 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  44.7 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  49.62 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  46.21 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  44.49 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  47.27 
 
 		 289 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  46.84 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  46.47 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  47.21 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  46.55 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  46.39 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  37.31 
 
 		 276 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  48.06 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  43.56 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  37.83 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  44.44 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  36.7 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  40.3 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  39.02 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  38.93 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  34.46 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  38.26 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  38.95 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  38.26 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  38.26 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  41.64 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  37.88 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  41.85 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  36.06 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  46.77 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  37.55 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  39.21 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.29 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  38.87 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  36.4 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  38.29 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.29 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  36.6 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.61 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  38.52 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.61 
 
 		 292 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.62 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  37.41 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  38.97 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  38.13 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  37.5 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  39.46 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  37.37 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  34.8 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  42.75 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1409  HpcH/HpaI aldolase  39.35 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000390566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  36.68 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.58 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.7 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  43.63 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.05 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  38.41 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.7 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.7 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.7 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  36.64 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  39.55 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  37.19 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  33.45 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  36.53 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  36.53 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  36.53 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  44.97 
 
 		 189 aa  122  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  34.64 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  31.99 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  34.57 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>