22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1671 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  490  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  31.63 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0335  protein of unknown function DUF1239  38.22 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143778  normal  0.315506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  26.34 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  27.14 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  27.05 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  24.88 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  25.85 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  25.98 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  29.11 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  30.08 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  25.87 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  28.28 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  31.65 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  24.49 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  27.83 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  27.83 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  24.35 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  23.46 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  24.26 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  27.27 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>