48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1639 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  100 
 
 
167 aa  328  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  57.49 
 
 
167 aa  192  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  59.26 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  54.94 
 
 
169 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  54.32 
 
 
169 aa  174  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  54.94 
 
 
169 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  53.01 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  53.7 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  53.09 
 
 
169 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  54.94 
 
 
169 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  55 
 
 
169 aa  170  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  53.37 
 
 
168 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  53.7 
 
 
169 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  52.47 
 
 
169 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  52.15 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  51.53 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  53.7 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  49.02 
 
 
168 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  46.91 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  44.17 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  41.51 
 
 
167 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  31.91 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  26.39 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  25.42 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  23.38 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  29.79 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  33.98 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  31.91 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  26.79 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  27.73 
 
 
193 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  22.81 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  28.57 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  28.57 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  25.38 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  29.63 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  30.19 
 
 
176 aa  44.3  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  28.7 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  28.7 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  29.29 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  24.37 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  26.02 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  32 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  31.4 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  28.7 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  31.33 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  28.3 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.73 
 
 
186 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>