154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1612 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1612  RNA procession exonuclease-like protein  100 
 
 		 354 aa  706    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  60.6 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  60.42 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  59.59 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  60.3 
 
 		 336 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  62.39 
 
 		 347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  60.3 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4043  putative mRNA 3-end processing factor  60.37 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  62.57 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  62.24 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1471  putative mRNA 3-end processing factor  61.08 
 
 		 348 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  60.96 
 
 		 351 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  61.63 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  58.61 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  61.21 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  60.12 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  59.51 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  60.74 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  59.76 
 
 		 348 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  60.43 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  59.2 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  58.01 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  58.48 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  58.59 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  59.52 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  58.82 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  58.73 
 
 		 329 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  58.39 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  57.62 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  45.37 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  46.41 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  45.07 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  46.41 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  42.77 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  45.45 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  42.18 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5293  putative exonuclease involved in mRNA processing  44.85 
 
 		 382 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  44.78 
 
 		 335 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  45.15 
 
 		 338 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  44.89 
 
 		 346 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  44.41 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  43.94 
 
 		 338 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  43.5 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  43.64 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  43.93 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  44.3 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  42.27 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2959  mRNA 3'-end processing factor  45.69 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624115  hitchhiker  0.0000489273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  43.16 
 
 		 383 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  43.07 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  44.23 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  37.99 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  43.71 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1519  hypothetical protein  44.68 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  32.7 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  38.83 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  37.08 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  32.08 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  32.08 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  37.39 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2414  hypothetical protein  42.68 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  42.68 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1568  RNA procession exonuclease-like protein  43.49 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  35.24 
 
 		 351 aa  202  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08581  RNA processing exonuclease  31.61 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0814782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2587  hypothetical protein  41.48 
 
 		 342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136385 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  33.53 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  38.37 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  36.15 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  36.81 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.48 
 
 		 1017 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0072  putative mRNA 3'-end processing factor  30.5 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0055  putative mRNA 3'-end processing factor  30.5 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0060  putative mRNA 3'-end processing factor  30.5 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0057  putative mRNA 3'-end processing factor  29.13 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  28.62 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  26.5 
 
 		 314 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  29.02 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1113  hypothetical protein  27.06 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.704257 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  24.29 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2308  hypothetical protein  31.31 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146289  normal  0.484856 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1169  conserved hypothetical protein  24.15 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.561924  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1132  hypothetical protein  30.2 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00888  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1852  putative mRNA 3-end processing factor  26.85 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.681251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0149  RNA procession exonuclease-like protein  22.54 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0104249 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  27.35 
 
 		 884 aa  66.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  21 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  22.62 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  26.48 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  21.99 
 
 		 616 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 451 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  27.88 
 
 		 455 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 603 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  25.27 
 
 		 589 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 455 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  25.9 
 
 		 472 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  25.9 
 
 		 472 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>