More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1593 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1593  ABC transporter related  100 
 
 
504 aa  957    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4514  ABC transporter related  56.05 
 
 
498 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0372056  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6411  ABC transporter related  56.25 
 
 
498 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000554602  normal  0.729468 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.19 
 
 
498 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3885  ABC transporter related protein  50.1 
 
 
509 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3688  ABC transporter related  49.9 
 
 
509 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3929  ABC transporter-related protein  50 
 
 
517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.992166  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0763  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 
505 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.831413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3343  ABC transporter related  49.8 
 
 
505 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2713  ABC transporter related  45.15 
 
 
510 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.09 
 
 
499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.97 
 
 
501 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  40 
 
 
524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.43 
 
 
516 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  39.79 
 
 
524 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  39.79 
 
 
524 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.27 
 
 
496 aa  332  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3093  ABC transporter related  42.08 
 
 
501 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.193565  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  40.34 
 
 
524 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  39.23 
 
 
518 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  40.34 
 
 
524 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.49 
 
 
527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  39.92 
 
 
524 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.08 
 
 
512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  40.04 
 
 
517 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  38.43 
 
 
503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  35.8 
 
 
525 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  38.04 
 
 
501 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  36.07 
 
 
502 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
525 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 
494 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 
501 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  36.51 
 
 
497 aa  323  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  38 
 
 
513 aa  323  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  37.67 
 
 
501 aa  323  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.19 
 
 
514 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  34.55 
 
 
501 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  37.71 
 
 
515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  35.83 
 
 
506 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  37.58 
 
 
495 aa  320  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  41.05 
 
 
511 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.32 
 
 
496 aa  319  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  40.08 
 
 
507 aa  319  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.66 
 
 
503 aa  319  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  37.67 
 
 
501 aa  319  9e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  37.12 
 
 
496 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  38.2 
 
 
504 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 
496 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
504 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.45 
 
 
503 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  38.59 
 
 
504 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  38.31 
 
 
507 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  41.39 
 
 
519 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  37.5 
 
 
501 aa  317  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  40.04 
 
 
521 aa  316  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  37.35 
 
 
496 aa  316  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  36.31 
 
 
511 aa  316  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2343  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
518 aa  316  8e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288241  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 
523 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
511 aa  315  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 
523 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  37.31 
 
 
512 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3337  ABC transporter related  37.6 
 
 
521 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 
523 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  40.7 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 
504 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  37.5 
 
 
515 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  38.16 
 
 
513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.77 
 
 
497 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  36.62 
 
 
509 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  36.71 
 
 
494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  34.96 
 
 
494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  40.31 
 
 
502 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  34.55 
 
 
501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  37.5 
 
 
500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  36.2 
 
 
501 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  33.94 
 
 
492 aa  313  6.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  38.65 
 
 
511 aa  312  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.81 
 
 
501 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  36.81 
 
 
501 aa  312  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 
507 aa  312  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
498 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  38.36 
 
 
513 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  36.81 
 
 
501 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  36.81 
 
 
501 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  36.81 
 
 
501 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2723  ABC transporter related  40.04 
 
 
515 aa  312  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  36.81 
 
 
501 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  37.17 
 
 
500 aa  311  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  36.42 
 
 
520 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  37.9 
 
 
525 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.95 
 
 
512 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  33.99 
 
 
507 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  37.4 
 
 
504 aa  311  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  37.83 
 
 
501 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  39.39 
 
 
509 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  36.81 
 
 
501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  39.92 
 
 
500 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>