288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1551 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  305  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  54.97 
 
 
152 aa  160  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  46.84 
 
 
160 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  46.2 
 
 
160 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
160 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  44.08 
 
 
153 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  43.59 
 
 
155 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  42.31 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  42.48 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  42.31 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  44.74 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  44.94 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  41.83 
 
 
155 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  43.14 
 
 
140 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  44.37 
 
 
152 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  41.67 
 
 
156 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  42.24 
 
 
160 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  40.65 
 
 
156 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  39.61 
 
 
154 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 
160 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  35.03 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 
160 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 
185 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  37.01 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  41.56 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  40.52 
 
 
153 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
170 aa  97.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  41.67 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  39.47 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  39.47 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  36.54 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  40.24 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  40.51 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 
160 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  95.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  42.76 
 
 
155 aa  94.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 
160 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 
160 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  39.29 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  43.03 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  43.03 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  43.54 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
155 aa  92  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  38.15 
 
 
174 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  43.09 
 
 
135 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
156 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  36.36 
 
 
155 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  40.4 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4518  protein of unknown function DUF163  42.28 
 
 
134 aa  91.3  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.600852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
160 aa  91.3  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  33.75 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  40.88 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  40.52 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  29.11 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  35.71 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  29.75 
 
 
159 aa  90.5  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  35.71 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  35.71 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  32.08 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  38.12 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  37.84 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  39.6 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
159 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  40.38 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  29.75 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  89  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  39.35 
 
 
156 aa  89  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  29.11 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  38.31 
 
 
156 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  32.9 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  34.42 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  34.42 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>