More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1541 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
326 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  69.03 
 
 
307 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  67.1 
 
 
323 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  65.81 
 
 
327 aa  418  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  64.52 
 
 
327 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  64.31 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.85 
 
 
343 aa  414  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  64.84 
 
 
323 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  65.81 
 
 
324 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  66.45 
 
 
347 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  62.82 
 
 
365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  65.16 
 
 
323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.5 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  64.84 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  65.16 
 
 
323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.14 
 
 
357 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.14 
 
 
357 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.59 
 
 
338 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  65.56 
 
 
323 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  64.9 
 
 
323 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.82 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  65.05 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  61.94 
 
 
375 aa  388  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  60.97 
 
 
370 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  59.38 
 
 
370 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  59.68 
 
 
370 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  58.06 
 
 
359 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  61.04 
 
 
343 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.92 
 
 
358 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  57.42 
 
 
370 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  57.23 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  52.98 
 
 
350 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  51.77 
 
 
351 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  49.7 
 
 
343 aa  295  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  48.65 
 
 
343 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.96 
 
 
303 aa  247  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.08 
 
 
298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.2 
 
 
346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.76 
 
 
306 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.33 
 
 
334 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.39 
 
 
347 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  43.96 
 
 
302 aa  235  8e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  44.41 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  43.62 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  42.86 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.86 
 
 
302 aa  232  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.6 
 
 
301 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  42.81 
 
 
304 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.06 
 
 
332 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  43.29 
 
 
302 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  42.47 
 
 
304 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.58 
 
 
304 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  43.67 
 
 
305 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.41 
 
 
323 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  40.39 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.42 
 
 
344 aa  225  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  43.32 
 
 
322 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  42.18 
 
 
303 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  45.96 
 
 
332 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  42.86 
 
 
304 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  40.26 
 
 
306 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  37.89 
 
 
325 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  41.61 
 
 
307 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  40.07 
 
 
304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.87 
 
 
308 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  42.52 
 
 
321 aa  222  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  40.52 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  41.89 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  37.58 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.65 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  39.02 
 
 
325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  40 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  41.04 
 
 
319 aa  220  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  41.91 
 
 
322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.33 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  41.59 
 
 
334 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  40 
 
 
324 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  37.7 
 
 
313 aa  218  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
326 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  41.88 
 
 
308 aa  218  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  38.69 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  38.24 
 
 
323 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.35 
 
 
330 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  41.3 
 
 
334 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  38.36 
 
 
323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  37.38 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  38.03 
 
 
310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  42.69 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.33 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  39.6 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.58 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  39.16 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  37.01 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.77 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  37.38 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.21 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  41.56 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2798  quinolinate synthetase  42.69 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  35.31 
 
 
304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  40.33 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>